Distribuisci Illumina DRAGEN sul Cloud AWS con il nuovo Quick Start

Inserito il: Oct 2, 2018

In circa 15 minuti, questo Quick Start distribuisce sul Cloud AWS un’analisi di lettura dinamica per GENomics Complete Suite (DRAGEN CS), una piattaforma di analisi dei dati di Illumina.

DRAGEN CS consente di eseguire un'analisi ultrarapida dei dati di sequenziamento di prossima generazione (NGS), riduce, in modo significativo, il tempo di analisi dei dati genomici e ne migliora la precisione. Include pipeline di bioinformatica che forniscono algoritmi altamente ottimizzati per la mappatura, l'allineamento, l'ordinamento, la marcatura duplicata e la chiamata di varianti di aplotipi. Queste pipeline includono DRAGEN Germline V2, DRAGEN Somatic V2 (con le seguenti varianti: tumore e tumore/normale), DRAGEN Virtual Long Read Detection (VLRD), DRAGEN RNA Gene Fusion, DRAGEN Joint Genotyping e best practice GATK.

Quick Start crea un ambiente AWS che si estende su due zone di disponibilità, quest’ultima molto elevata, e fornisce due ambienti di calcolo AWS Batch per istanze Spot e on demand. Questi ambienti includono istanze DRAGEN F1 collegate ad array FPGA che consentono l’accelerazione hardware.

Per iniziare:

Puoi anche scaricare i modelli di AWS CloudFormation che automatizzano la distribuzione da GitHub.
 
Per esplorare e avviare altre distribuzioni di riferimento di AWS Quick Start, consulta il nostro catalogo completo.
 
I Quick Start sono distribuzioni di riferimento automatizzate che impiegano i modelli di AWS CloudFormation per distribuire tecnologie avanzate in AWS, in conformità alle best practice. Questo Quick Start è stato creato da Illumina in collaborazione con i solutions architect di AWS. Illumina è un partner tecnologico di AWS di livello Advanced.